El justificante de firma, también conocido como stamper, sello, CSV (código seguro de verificación), etc, NO modifica el contenido del PDF porque lo hacemos acorde al estándar de firma de PDF.
Este estándar determina cómo y dónde se pueden/deben usar estas «representaciones gráficas» (anotaciones según el diccionario de datos del PDF), y más en concreto, anotaciones asociadas a una firma electrónica.
Por tanto, y a modo de resumen, NO modifica el contenido. Se trata de una anotación agregada en una capa habilitada para tal propósito en el diccionario de datos del estándar PDF.